by Mattia Miotto, Enzo Marinari, Andrea De Martino
microRNAs (miRNAs) regulate gene expression at post-transcriptional level by repressing target RNA molecules. Competition to bind miRNAs tends in turn to correlate their targets, establishing effective RNA-RNA interactions that can influence expression levels, buffer fluctuations and promote signal propagation. Such a potential has been characterized mathematically for small motifs both at steady state and away from stationarity. Experimental evidence, on the other hand, suggests that competing endogenous RNA (ceRNA) crosstalk is rather weak. Extended miRNA-RNA networks could however favour the integration of many crosstalk interactions, leading to significant large-scale effects in spite of the weakness of individual links. To clarify the extent to which crosstalk is sustained by the miRNA interactome, we have studied its emergent systemic features in silico in large-scale miRNA-RNA network reconstructions. We show that, although generically weak, system-level crosstalk patterns (i) are enhanced by transcriptional heterogeneities, (ii) can achieve high-intensity even for RNAs that are not co-regulated, (iii) are robust to variability in transcription rates, and (iv) are significantly non-local, i.e. correlate weakly with miRNA-RNA interaction parameters. Furthermore, RNA levels are generically more stable when crosstalk is strongest. As some of these features appear to be encoded in the network’s topology, crosstalk may functionally be favoured by natural selection. These results suggest that, besides their repressive role, miRNAs mediate a weak but resilient and context-independent network of cross-regulatory interactions that interconnect the transcriptome, stabilize expression levels and support system-level responses.
Филиал № 4 ОСФР по Москве и Московской области информирует:
Отделение СФР по Москве и Московской области выплатило единовременное пособие при передаче ребенка на воспитание в семью 474 семьям региона
В Дубне сотрудники Росгвардии помогли утиному семейству перейти оживленную трассу
СЕНСАЦИОННЫЙ ДОКЛАД ПРО ДЕЛО СКРИПАЛЕЙ, САФРОНОВА, ГОЛУНОВА.
ЭКСПЕРТ АНАТОЛИЙ ГОЛОД ПРЕДЛАГАЕТ СЕНСАЦИОННО УЛУЧШИТЬ НАЛОГОВУЮ СФЕРУ!
В Дубне сотрудники Росгвардии помогли утиному семейству перейти оживленную трассу
Роспотребнадзор изъял всю продукцию, приведшую к массовым отравлениям
По следу идут специалисты: в Балашихе стартовал чемпионат Москвы по многоборью среди кинологов
Филиал № 4 ОСФР по Москве и Московской области информирует:
Отделение СФР по Москве и Московской области выплатило единовременное пособие при передаче ребенка на воспитание в семью 474 семьям региона
Александр Розенбаум проиграл суды коммунальщикам на 386 тысяч рублей
«Он приехал за мной в клуб. И всё, с этого момента мы начали жить вместе». Оксана Самойлова рассказала о знакомстве с Джиганом в эфире «Шоу Воли» на ТНТ
Розенбаум проиграл суд из-за неуплаты счетов за энергоснабжение
Память Жанны Фриске почтили посмертной наградой и ее песней на музыкальной премии
Филиал № 4 ОСФР по Москве и Московской области информирует:
Отделение СФР по Москве и Московской области выплатило единовременное пособие при передаче ребенка на воспитание в семью 474 семьям региона
СЕНСАЦИОННЫЙ ДОКЛАД ПРО ДЕЛО СКРИПАЛЕЙ, САФРОНОВА, ГОЛУНОВА.
В России запустили бесплатного цифрового ЗОЖ-помощника
Как Россия уступила Азербайджану значительные территории Дагестана и два села