by Amirhossein Tahmouresi, Esmat Rashedi, Mohammad Mehdi Yaghoobi, Masoud Rezaei
Genetics play a prominent role in the development and progression of malignant neoplasms. Identification of the relevant genes is a high-dimensional data processing problem. Pyramid gravitational search algorithm (PGSA), a hybrid method in which the number of genes is cyclically reduced is proposed to conquer the curse of dimensionality. PGSA consists of two elements, a filter and a wrapper method (inspired by the gravitational search algorithm) which iterates through cycles. The genes selected in each cycle are passed on to the subsequent cycles to further reduce the dimension. PGSA tries to maximize the classification accuracy using the most informative genes while reducing the number of genes. Results are reported on a multi-class microarray gene expression dataset for breast cancer. Several feature selection algorithms have been implemented to have a fair comparison. The PGSA ranked first in terms of accuracy (84.5%) with 73 genes. To check if the selected genes are meaningful in terms of patient’s survival and response to therapy, protein-protein interaction network analysis has been applied on the genes. An interesting pattern was emerged when examining the genetic network. HSP90AA1, PTK2 and SRC genes were amongst the top-rated bottleneck genes, and DNA damage, cell adhesion and migration pathways are highly enriched in the network.
Отрытый конкурс красоты и таланта «Одна на миллион»
Филиал № 4 ОСФР по Москве и Московской области информирует:
За полгода 14,9 тысячи жителей Московского региона оформили страховую пенсию в автоматическом режиме на портале госуслуг
Спортивные игры в СЛД "Москва-Сортировочная" филиала "Московский"
Представители «Метровагонмаш-Сервиса» посетили СЛД «Москва-Сортировочная» филиала «Московский» компании «ЛокоТех-Сервис» для обмена опытом
Mikel Arteta demands more Arsenal signings as he gives cryptic update on Riccardo Calafiori transfer
Exclusive - Sayantani Ghosh expresses happiness as sets of her show Dahej Daasi shifted close to her home; says 'I've been manifesting this for quite some time now'
Suspect arrested for ‘threatening to kill Trump and his VP pick JD Vance’ in Florida days after assassination attempt
Why you should buy physical copies of your favorite books
Представители «Метровагонмаш-Сервиса» посетили СЛД «Москва-Сортировочная» филиала «Московский» компании «ЛокоТех-Сервис» для обмена опытом
Деревенские картинки....
Филиал № 4 ОСФР по Москве и Московской области информирует:
За полгода 14,9 тысячи жителей Московского региона оформили страховую пенсию в автоматическом режиме на портале госуслуг
Филиал № 4 ОСФР по Москве и Московской области информирует:
За полгода 14,9 тысячи жителей Московского региона оформили страховую пенсию в автоматическом режиме на портале госуслуг
Самой перспективной для трудоустройства назвали Амурскую область
22 июля Всемирный день мозга. Отвечаем на популярные вопросы о когнитивных расстройствах
Кажетта Ахметжанова: какие цифры в дате рождения отвечают за денежный магнетизм человека