A quantitative modelling approach for DNA repair on a population scale
by Leo Zeitler, Cyril Denby Wilkes, Arach Goldar, Julie Soutourina
The great advances of sequencing technologies allow the
in vivo measurement of nuclear processes—such as DNA repair after UV exposure—over entire cell populations. However, data sets usually contain only a few samples over several hours, missing possibly important information in between time points. We developed a data-driven approach to analyse CPD repair kinetics over time in
Saccharomyces cerevisiae. In contrast to other studies that consider sequencing signals as an average behaviour, we understand them as the superposition of signals from independent cells. By motivating repair as a stochastic process, we derive a minimal model for which the parameters can be conveniently estimated. We correlate repair parameters to a variety of genomic features that are assumed to influence repair, including transcription rate and nucleosome density. The clearest link was found for the transcription unit length, which has been unreported for budding yeast to our knowledge. The framework hence allows a comprehensive analysis of nuclear processes on a population scale.
Moscow.media
Частные объявления сегодня
Амбассадор фонда без кистей рук установил мировой рекорд в дисциплине стронгмен
Свыше 6,5 тысячи жителей Москвы и Московской области получили справки о статусе предпенсионера в клиентских службах регионального Отделения СФР и МФЦ
Мытищинское предприятие ООО «Водомер» получило Диплом победителя в региональном конкурсе «100 лучших товаров России»
В этом году Отделение СФР по Москве и Московской области компенсировало стоимость полиса ОСАГО 1 192 жителям региона
Жители Сыктывкара помогут сделать родной город чище
ГПМ Радио участвует в деловой программе Московского медиафестиваля на ВДНХ
Жители Тюмени помогут сделать родной город чище
Радио Romantika рекомендует open-air «Легенды мирового рока»
Former Jamaica ace hopes new guide for mums in football leads to better support for female players with children
America ramps up hunt for Hamas boss Yahya Sinwar to try to stop all-out Middle East war
Deontay Wilder Rules Out Incredible Comeback Fight Offer: “Not Interested”
Boeing ‘humiliated’ over upstart rival SpaceX rescuing stuck astronauts | Reporter Replay
В Челябинской области задержали автомобилиста, сбившего двух молодых пешеходов на обочине
С начала 2024 года более 2,5 тысячи многодетных мам в Московском регионе досрочно вышли на пенсию
Мытищинское предприятие ООО «Водомер» получило Диплом победителя в региональном конкурсе «100 лучших товаров России»
В этом году Отделение СФР по Москве и Московской области компенсировало стоимость полиса ОСАГО 1 192 жителям региона
Drive Zone Online 1.0.0 (502)
Clair Obscur: Expedition 33 creative director speaks about the dark fantasy RPG's stunning Unreal Engine 5 graphics: 'It’s a key foundation for the studio to really look for the latest technology'
10 tips to get started in Star Wars Outlaws
Выживач Tiles of Survive доступен в Google Play 27 стран
Радио Romantika рекомендует open-air «Легенды мирового рока»
Пиратский «День именинника» отметили в ТРЦ «Нора»
Отделение СФР по Москве и Московской области предостерегает: не поддавайтесь на уловки мошенников!
Мегадискотека Детского радио «Дети как звезды!» пройдет 1 сентября в Москве и Санкт-Петербурге
Мытищинское предприятие ООО «Водомер» получило Диплом победителя в региональном конкурсе «100 лучших товаров России»
Амбассадор фонда без кистей рук установил мировой рекорд в дисциплине стронгмен
Озвучены шесть условий мира: Стали известны итоги ключевой встречи с участием Путина
Дурова обязали проживать по определенному адресу во Франции
ТАСС: Рожков назвал заслуженным серебро пловца Даниленко на Паралимпиаде
Около 90 нижегородских предпринимателей приняли участие в Дне поставщика деревообрабатывающей и легкой промышленности
СЕРГЕЙ БОРИСОВ. МИХАИЛ РОЗАНОВ. ГОРОД СКАЗКА
«Спартак» победил «Динамо» в матче Кубка мэра Москвы
Анна Блинкова проиграла Эмме Наварро на старте Открытого чемпионата США
Дарья Касаткина завершила участие на US Open
Хуберт Хуркач одолел Тимофея Скатова на старте Открытого чемпионата США — 2024
У Сейбота Уайлда в конце матча с Рублевым начались судороги
Курировал науку, оказался под санкциями ЕС в 2020 году и владеет недвижимостью на сумму свыше полумиллиона рублей: что известно о задержанном экс-замминистра обороны Попове
Временного заместителя главы Севастополя Горлова арестовали за взятку
Московский экономический форум на Алтае: Подобные проблемы мы уже видели в Крыму!
Арестован простреливший ребенку руку в Подмосковье мужчина
Музыкальные новости
Певец Андрей Макаревич заявил, что может сделать совместный концерт с Вайкуле
Артисты из Санкт-Петербурга покажут в Крыму музыкально-поэтические спектакли об Ахматовой и Окуджаве
Крымские каникулы: «Голоса Градского» представили уникальную концертную программу
Гергиев откроет сезоны в Мариинском и в Большом театрах
Радио Romantika рекомендует open-air «Легенды мирового рока»
Концерты при свечах в усадьбе XIX века при поддержке Relax FM
Мегадискотека Детского радио «Дети как звезды!» пройдет 1 сентября в Москве и Санкт-Петербурге
Радио Romantika рекомендует open-air «Легенды мирового рока»
Певицу Клаву Коку экстренно забрали в больницу
Казанский гроссмейстер Владислав Артемьев снова стал чемпионом России, второе место занял ростовчанин Андрей Есипенко, третье – Даниил Дубов из Москвы, а петербуржец Максим Матлаков финишировал десятым
Сергей Собянин: Стандарт оказания медпомощи стал выше
В Подмосковье сотрудники Росгвардии задержали подозреваемого в краже из сетевого магазина
В результате ДТП в Москве погибла женщина и пострадал ребенок
Мэрия Москвы защитила детей от ГИБДД // Полиция и чиновники разошлись в оценках роста детской аварийности
Отечественные грузовые шины прошли испытания в рамках ралли-марафона «Шелковый путь–2024»
Прокуратура Москвы возбудила дело о смертельном ДТП на 1-й Владимирской улице
"Путин все понял". На Западе сделали неожиданное заявление о России
Михаил Евраев доложил Президенту России Владимиру Путину о развитии Ярославской области
В Арктике разворачивается «гонка вооружений». США пытаются препятствовать сотрудничеству РФ и КНР
Суд признал законной блокировку сайта независимого саратовского издания
Форум «Активное долголетие в Подмосковье» прошел в Одинцове
Что известно о новой опасной болезни, которую вызывают вейпы и электронные сигареты
Доктор Юзуп рассказала, как реакция организма на продукты может рассказать о скрытых заболеваниях
Как увеличить прибыль клиники до 30%, повысив квалификацию врачей
Киев посадит за штурвалы пенсионеров: что еще выпросит Зеленский на предстоящей встрече с Байденом
В Киеве обвинили Зеленского в краже денег у пенсионеров
«Спартак» победил «Динамо» в матче Кубка мэра Москвы
Форум «Активное долголетие в Подмосковье» прошел в Одинцове
Росгвардейцы обеспечили безопасность на футбольных матчах РПЛ в Москве
Отечественные грузовые шины прошли испытания в рамках ралли-марафона «Шелковый путь–2024»
Лукашенко заявил, что не прикажет военным идти воевать за пределы страны
Лукашенко заявил, что не позволит белорусской армии воевать за пределами страны
На 99%: чем опасен возможный разворот Минска от Москвы в сторону Запада?
Собянин рассказал об открытии нового здания школы №1392 в Филимонковском районе
Мэр Москвы рассказал о ходе строительства нового автомобильного моста
Сергей Собянин рассказал, как Москва поддерживает многодетные семьи
Сергей Собянин. Главное за день
Ивановское торнадо: как в центре России 9 июня 1984 года летали дома и коровы
В Москве задержали подозреваемого в расправе над бездомными в Бутовском парке
В Сбере назвали изменение климата одним из главных рисков в следующие 10 лет
Москва представила аналитическое исследование климатической повестки городов БРИКС
Мегадискотека Детского радио «Дети как звезды!» пройдет 1 сентября в Москве и Санкт-Петербурге
Временного заместителя главы Севастополя Горлова арестовали за взятку
Курировал науку, оказался под санкциями ЕС в 2020 году и владеет недвижимостью на сумму свыше полумиллиона рублей: что известно о задержанном экс-замминистра обороны Попове
Отечественные грузовые шины прошли испытания в рамках ралли-марафона «Шелковый путь–2024»
Беспроводной сканер штрих-кодов SAOTRON P05i промышленного класса
Портативный ТСД корпоративного класса Saotron RT-T70
Денис Мантуров встретился с губернатором Архангельской области Александром Цыбульским
В Арктике разворачивается «гонка вооружений». США пытаются препятствовать сотрудничеству РФ и КНР
Людей чудом не оказалось на остановке, в которую влетела BMW
«Уходящая натура». Доходность в Севастополе от студий выше, чем в Симферополе
Часть Симферполя без света, Евпатория и часть Ялты без воды
Акция-настроение «С книжных страниц – на большой экран»
На строительство моста в Вязьме выделили почти 1,8 миллиарда рублей
Петербург занял третье место в рейтинге популярных городов для семейного отдыха
Московский экономический форум на Алтае: Подобные проблемы мы уже видели в Крыму!
Сенсация в делах Павла Дурова, Павла и Ивана Попова. И другие очень важные данные для России и всего мира.