by Aidan Burn, Farrah Roy, Michael Freeman, John M. Coffin
Human endogenous retrovirus (HERV) transcripts are known to be highly expressed in cancers, yet their activity in nondiseased tissue is largely unknown. Using the GTEx RNA-seq dataset from normal tissue sampled at autopsy, we characterized individual expression of the recent HERV-K (HML-2) provirus group across 13,000 different samples of 54 different tissues from 948 individuals. HML-2 transcripts could be identified in every tissue sampled and were elevated in the cerebellum, pituitary, testis, and thyroid. A total of 37 different individual proviruses were expressed in 1 or more tissues, representing all 3 LTR5 subgroups. Nine proviruses were identified as having long terminal repeat (LTR)-driven transcription, 7 of which belonged to the most recent LTR5HS subgroup. Proviruses of different subgroups displayed a bias in tissue expression, which may be associated with differences in transcription factor binding sites in their LTRs. Provirus expression was greater in evolutionarily older proviruses with an earliest shared ancestor of gorilla or older. HML-2 expression was significantly affected by biological sex in 1 tissue, while age and timing of death (Hardy score) had little effect. Proviruses containing intact gag, pro, and env open reading frames (ORFs) were expressed in the dataset, with almost every tissue measured potentially expressing at least 1 intact ORF (gag).
Спортивные игры в СЛД "Москва-Сортировочная" филиала "Московский"
Отрытый конкурс красоты и таланта «Одна на миллион»
Филиал № 4 ОСФР по Москве и Московской области информирует:
С начала 2024 года 140 тысяч женщин и новорожденных Московского региона получили услуги по родовым сертификатам
Представители «Метровагонмаш-Сервиса» посетили СЛД «Москва-Сортировочная» филиала «Московский» компании «ЛокоТех-Сервис» для обмена опытом
Филиал № 4 ОСФР по Москве и Московской области информирует:
За полгода 14,9 тысячи жителей Московского региона оформили страховую пенсию в автоматическом режиме на портале госуслуг
22 июля Всемирный день мозга. Отвечаем на популярные вопросы о когнитивных расстройствах
После появления «New Москва» на этом райском острове Богов, Россия открывает там Генеральное Консульство: русских так много, что надо их пересчитать
Кажетта Ахметжанова: какие цифры в дате рождения отвечают за денежный магнетизм человека