Beyond a PPR-RNA recognition code: Many aspects matter for the multi-targeting properties of RNA editing factor PPR56
by Yingying Yang, Kira Ritzenhofen, Jessica Otrzonsek, Jingchan Xie, Mareike Schallenberg-Rüdinger, Volker Knoop
The mitochondrial C-to-U RNA editing factor PPR56 of the moss
Physcomitrium patens is an RNA-binding pentatricopeptide repeat protein equipped with a terminal DYW-type cytidine deaminase domain. Transferred into
Escherichia coli , PPR56 works faithfully on its two native RNA editing targets, nad3eU230SL and nad4eU272SL, and also converts cytidines into uridines at over 100 off-targets in the bacterial transcriptome. Accordingly, PPR56 is attractive for detailed mechanistic studies in the heterologous bacterial setup, allowing for scoring differential RNA editing activities of many target and protein variants in reasonable time. Here, we report (i) on the effects of numerous individual and combined PPR56 protein and target modifications, (ii) on the spectrum of off-target C-to-U editing in the bacterial background transcriptome for PPR56 and two variants engineered for target re-direction and (iii) on combinations of targets in tandem or separately at the 5’- and 3’-ends of large mRNAs. The latter experimentation finds enhancement of RNA editing at weak targets in many cases, including cox3eU290SF as a new candidate mitogenome target. We conclude that C-to-U RNA editing can be much enhanced by transcript features also outside the region ultimately targeted by PPRs of a plant editing factor, possibly facilitated by its enrichment or scanning along transcripts.
Читайте также:
11.08.2024 13:38
11.08.2024 13:35
11.08.2024 13:29
11.08.2024 13:30
Moscow.media
Частные объявления сегодня
Большой стадионный концерт MACAN в Москве при поддержке Like FM
Квартальная выручка Freedom Holding Corp. выросла до $450,7 млн
Мари Краймбрери, Звонкий, DAASHA выступят на марафоне «Авторадио»
«Сады и люди»: что можно увидеть рассказывает Радио Romantika
Обложка песни. Обложки альбомов песен. Сделать обложку для песни.
Как записать дядю в телефоне
8 самых полезных трав, которые можно собрать самостоятельно: рейтинг
В Курской, Брянской и Белгородской областях официально введен режим КТО.
Evolving Trends in Realistic Sex Doll Manufacturing
Airbnb shares slumps as weak forecast signals slowing travel demand
Angel Ayala Twice Floors Dave Apolinario In 6th Round Knockout To Win IBF Flyweight Title
The Rise of Robotic Realism: Exploring the Future of Sex Dolls
Врач назвал самые полезные для здоровья сочетания гречки с продуктами
В Ростовской области кот спас бельчонка, притащив его к людям
Большой стадионный концерт MACAN в Москве при поддержке Like FM
Фанаты серии игр Legacy Of Kain смогут получить легендарный меч Похититель душ
You can get every Dragon Age game yet made for just $10 in EA's August Steam sale
Geralt's voice actor confirms he'll be in the next Witcher, but not as the main character: 'Geralt will be part of the game'
Bungie promises to address the 'uncertainty' surrounding the future of Destiny 2 following massive layoffs last week
Преимущества автоматики для ворот Came
Мари Краймбрери, Звонкий, DAASHA выступят на марафоне «Авторадио»
Уголовное дело возбудили после смертельного ДТП с каршерингом в Москве
Школьник получил ожоги глаз из-за химического эксперимента в квартире в Москве
Почти 800 тонн мороженого произвели в Москве за 2 месяца лета
С чего начать: как правильно перейти на здоровый образ жизни
Артист Грек пожертвовал миллионы на борьбу с искусственным интеллектом, чтобы защитить будущее
День строителя: какие высокотехнологичные решения предлагают столичные промышленники для строительной отрасли
Музей Москвы откроет новую выставку в августе
Теннисист Зверев раскритиковал условия в Олимпийской деревне
Казахстанский юниор потренировался с теннисистом из топ-10 рейтинга ATP
Героиня России на Олимпиаде-2024: родилась в Жигулевске, поступила в универ в США, носит косынку
Ма Лун — первый в истории Китая обладатель шести золотых медалей Олимпийских игр
Инспекторы ЦОМП дежурят на выставке «Станция Манеж. Московский транспорт 2030»
С чего начать: как правильно перейти на здоровый образ жизни
Российский турист погиб при загадочных обстоятельствах на Пхукете
Эксперимент с ракетным топливом обернулся ожогами: московский подросток оказался в больнице
Музыкальные новости
«Вести себя как мерзость — ниже плинтуса»: Кучера о Панине, Пугачевой и СВО
Певица Теона Контридзе заявила, что удивилась обстановкой дома Цискаридзе
Обложка песни. Обложки альбомов песен. Сделать обложку для песни.
В Госдуме отреагировали на возмущение Волочковой сухим законом для артистов
«Крылья Советов» и воронежский «Факел» сойдутся в битве аутсайдеров РПЛ
Сотни гостей присоединились ко Дню физкультурника в парке у Музея Победы
Международный турнир по плаванию «Кубок чемпионов» состоялся в Пскове
Московский "Локомотив" обыграл махачкалинское "Динамо" в рамках РПЛ
В Москве задержали врезавшегося в дом на машине каршеринга подростка
Необычная стена из растений появилась у входа в Московский зоопарк
Российский турист погиб при загадочных обстоятельствах на Пхукете
ФПК назначила дополнительные поезда Белгород – Москва
Александр Цыбульский: "Наша задача - создать конкурентную экономику будущего"
Перспективы совершенствования оказания медицинской помощи в АЗРФ обсудили на форуме «Арктика — Регионы»
В Архангельской области 15-ти летний мотоциклист попал в ДТП
Жизнь людей под угрозой: В Архангельской области обнаружили 288,5 метра бесхозного газопровода
За издевательство над бездомным в Симферополе задержали двух треш-стримеров
Мы вернулись домой, уставшие, но как же хорошо в парке, все питомцы рады тебя видеть)
«Жизнь. Творчество. Судьба»
к 130-летию со дня рождения писателя, драматурга, переводчика
М. М. Зощенко
В Крыму задержали завотдела одной из симферопольских больниц за взятку
Инспекторы ЦОМП дежурят на выставке «Станция Манеж. Московский транспорт 2030»
Реабилитация эвакуированных из Курской области детей началась в Подмосковье
Жители Домодедова отправят гуманитарную помощь в Курскую область
Выпуск строительных металлоконструкций с января в Москве вырос на 54,5%