Detecting and quantifying heterogeneity in susceptibility using contact tracing data
by Beth M. Tuschhoff, David A. Kennedy
The presence of heterogeneity in susceptibility, differences between hosts in their likelihood of becoming infected, can fundamentally alter disease dynamics and public health responses, for example, by changing the final epidemic size, the duration of an epidemic, and even the vaccination threshold required to achieve herd immunity. Yet, heterogeneity in susceptibility is notoriously difficult to detect and measure, especially early in an epidemic. Here we develop a method that can be used to detect and estimate heterogeneity in susceptibility given contact by using contact tracing data, which is typically collected early in the course of an outbreak. This approach provides the capability, given sufficient data, to estimate and account for the effects of this heterogeneity before they become apparent during an epidemic. It additionally provides the capability to analyze the wealth of contact tracing data available for previous epidemics and estimate heterogeneity in susceptibility for disease systems in which it has never been estimated previously. The premise of our approach is that highly susceptible individuals become infected more often than less susceptible individuals, and so individuals not infected after appearing in contact networks should be less susceptible than average. This change in susceptibility can be detected and quantified when individuals show up in a second contact network after not being infected in the first. To develop our method, we simulated contact tracing data from artificial populations with known levels of heterogeneity in susceptibility according to underlying discrete or continuous distributions of susceptibilities. We analyzed this data to determine the parameter space under which we are able to detect heterogeneity and the accuracy with which we are able to estimate it. We found that our power to detect heterogeneity increases with larger sample sizes, greater heterogeneity, and intermediate fractions of contacts becoming infected in the discrete case or greater fractions of contacts becoming infected in the continuous case. We also found that we are able to reliably estimate heterogeneity and disease dynamics. Ultimately, this means that contact tracing data alone is sufficient to detect and quantify heterogeneity in susceptibility.
Moscow.media
Частные объявления сегодня
Филиал № 4 ОСФР по Москве и Московской области напоминает:
В Московском регионе 11,4 тысячи пап находятся в отпуске по уходу за ребенком
В День солидарности в борьбе с терроризмом подмосковные росгвардейцы приняли участие в памятной акции «Вместе против террора»
«Я чувствую вашу любовь!» – SHAMAN спел для слушателей «Авторадио»
Сотрудники Росгвардии задержали нетрезвого водителя в подмосковных Люберцах
Какие трикотажные изделия будут в моде этой осенью
«585*ЗОЛОТОЙ» отмечена в рейтинге лучших брендов Санкт-Петербурга
Годовая отчетная конференция Объединенного Совета ветеранов АО «Желдорреммаш» прошла в Челябинске
Bolton star forced to withdraw from squad after SNEEZING injury as manager says ‘he’s a powerful boy’
Watch Real Madrid star Tchouameni’s bizarre ‘Fifa glitch’ tackle as optical illusion leaves fans completely baffled
JESSE WATTERS: No one is really voting for Kamala Harris
Barron Trump’s College Decision Revealed as He Shows Up for First Day of Classes Flanked by Secret Service
В Екатеринбурге запретят стоянку на улицах Белинского и Раевского
ТСД SAOTRON RT41 GUN: практичный, производительный, надёжный
Клиенты компании «Байкал Сервис» экономят на перевозке сезонных грузов
МОШЕННИЧЕСТВО «ПОД ПРИКРЫТИЕМ»?
Risk of Rain 2's creators, along with 'many other' devs from Hopoo, have been snapped up by Valve—which means the end of the studio's unannounced game
1 млн предрегистраций на Nigoriri Angels on Stage и релиз на этой неделе
Court locks in Bungie's $4.4 million win against Destiny 2 cheat maker, refuses request for a new trial
Risk of Rain 2 creators weigh in on Gearbox's first DLC without them: 'It's great to see new content for the game, but it's hard to see growing pains of the new team in real time'
Заместитель управляющего ОСФР по г. Москве и Московской области Алексей Путин об индексации работающим пенсионерам
«Я чувствую вашу любовь!» – SHAMAN спел для слушателей «Авторадио»
Сотрудники Росгвардии задержали нетрезвого водителя в подмосковных Люберцах
Сотрудники Росгвардии задержали нетрезвого водителя в подмосковных Люберцах
Автора провального российского фильма Алексея Петрухина задержали за коррупцию
Будущее российских цирковых талантов обсудят на государственном уровне
Сотрудники Росгвардии задержали нетрезвого водителя в подмосковных Люберцах
Сотрудники Росгвардии задержали нетрезвого водителя в подмосковных Люберцах
Суд приостановил деятельность компании после падения ее автобуса в Мойку
Уголовное дело за дебош в поезде «Москва – Симферополь» возбудили в Воронеже
Ефимов: детский сад на 200 мест построят в районе Щербинка
Мэрия Москвы отчиталась о росте товарооборота со странами БРИКС
«Он открыто кричал на нее». Появились подробности расставания Рыбакиной с тренером
Ассоциация тенниса США признала ошибку в пользу соперницы россиянки на US Open
Матч Медведева и Боргеша на US Open прервали из-за пожарной тревоги
Серена Уильямс ответила, планирует ли возвращаться в WTA-тур
Самая обычная женщина: что известно о русской жене 81-летнего немецкого миллиардера
Владимир Машков в исторической картине «В списках не значился»
Пожарные напомнили школьникам о правилах безопасности
Зачем пытающейся забеременеть Кристине Асмус понадобился гусь: в прокат вышла комедия «Обе две» (12+)
Музыкальные новости
SHAMAN, Люся Чеботина, Олег Газманов, Хабиб и другие звезды поделились своими секретами со студентами Академии Игоря Крутого на кэмпе «Новая волна»
Рэпер Моргенштерн сообщил о глубочайшей депрессии и извинился за агрессию
Моргенштерн* психически нездоров и лечится: «Я признал свою болезнь, зависимости»
«Я чувствую вашу любовь!» – SHAMAN спел для слушателей «Авторадио»
Сотрудники Росгвардии задержали нетрезвого водителя в подмосковных Люберцах
Сотрудники Росгвардии задержали нетрезвого водителя в подмосковных Люберцах
Филиал № 4 ОСФР по Москве и Московской области информирует:
В Московском регионе 11,4 тысячи пап находятся в отпуске по уходу за ребенком
«Атомайз» стал победителем премии FinTech Awards 2024
«Динамо» Москва — «Куньлунь Ред Стар» — 1:3. Видеообзор матча КХЛ
В отчетной конференции Объединенного Совета ветеранов АО ЖДРМ принял участие представитель ветеранской организации Уссурийского ЛРЗ
Бастрыкин поручил возбудить дело о криминальной активности мигрантов в столице Камчатки
Москвичей предупредили о перекрытии дорог 6 сентября
Две полосы перекрыли на Можайском шоссе из-за столкновения легковушки с мотоциклом
Филиал № 4 ОСФР по Москве и Московской области информирует:
Гражданам Москвы и Московской области, получившим тяжелые производственные травмы, выданы автомобили марки «Лада Гранта»
Сотрудники Росгвардии задержали нетрезвого водителя в подмосковных Люберцах
Путин про Дурова: "у России не было никаких претензий к нему"
Во Франции требуют от Харрис объяснений после слов Путина о ее поддержке
Путин рассказал, что считал Дурова жителем Москвы
Путин пошутил о выборах в США - обозначен "приоритетный" кандидат: "Видно, что всё у неё хорошо"
Более 20 выпускников медицинского класса в Коломне поступили в профильные вузы
Врачи предупредили о возвращении в Москву сезона аллергии
Сергей Собянин рассказал о развитии роботической хирургии в Москве
Мобильные пункты вакцинации от гриппа рядом со станциями метро, МЦК и МЦД
Зеленский разработал «план победы» над Россией и намерен представить его Байдену
Экс-банкира Кононова приговорили к 12 годам за хищение денег у Радулова
«Динамо» Москва — «Куньлунь Ред Стар» — 1:3. Видеообзор матча КХЛ
Блогера-бодибилдера Шпака заочно приговорили за фейки о ВС России
«Динамо», несмотря на гол Гусева, проиграло «Куньлуню» в первом матче сезона
В Минске помилованы осужденные за протестные преступления
Собянин: более 130 объектов украсит архитектурно-художественная подсветка
Сергей Собянин: Проводим комплексную модернизацию
Сергей Собянин рассказал о задачах по повышению качества городской среды
Сергей Собянин рассказал о развитии роботической хирургии в Москве
На территории Южного округа Москвы прошли экорейды
Зеленый вектор: страны БРИКС уделяют все больше внимания экологии
Ирина Слуцкая: Ко Дню города проверили дно Мазиловского пруда
И ток, и вода. В Москве открылись четыре новых причала для электросудов
СК возбудил дело о мошенничестве против экс-заместителя главы МЧС РФ Барышева
Источник 360.ru: к месту убийства девочки в Нижнем Тагиле несут цветы и игрушки
В Москве осудили экс-главу Транснационального банка Кононова
Москвичи смогут поставить вакцину против гриппа в мобильных пунктах
Беспроводной сканер штрих-кодов SAOTRON P05i промышленного класса
Архангельские работодатели жалуются на старение населения в регионе
Путин: Россия намерена развивать университеты в Арктике и на Дальнем Востоке
ТСД SAOTRON RT41 GUN: практичный, производительный, надёжный
Беседа – предостережение
«Россия против террора!»,
ко Дню солидарности в борьбе с терроризмом.
1 и 2 сентября филиал РТРС «РТПЦ Республики Мордовия» и Министерство образования Республики Мордовия проведут совместную акцию, приуроченную ко Дню знаний и началу нового учебного года.
Выставка крымского имени «Тайны души и творчества Алемдара Караманова»
Вечер-аншлаг «Он жил, как песня, что длиною в жизнь»
Студенты Истринского педколледжа заложили капсулу времени
Банда бездомных мигрантов с оружием награбила в Москве 43 миллиона рублей
В Москве пять посвящённых школьным олимпиадам праздников пройдёт в сентябре
До 20 000 рублей увеличат доплату к пенсии для жителей Подмосковья старше 65 лет