Добавить новость
ru24.net
News in English
Январь
2025

A genome-scale metabolic model for the denitrifying bacterium Thauera sp. MZ1T accurately predicts degradation of pollutants and production of polymers

0

by Diego Tec-Campos, Juan D. Tibocha-Bonilla, Celina Jiang, Anurag Passi, Deepan Thiruppathy, Cristal Zuñiga, Camila Posadas, Alejandro Zepeda, Karsten Zengler

The denitrifying bacterium Thauera sp. MZ1T, a common member of microbial communities in wastewater treatment facilities, can produce different compounds from a range of carbon (C) and nitrogen (N) sources under aerobic and anaerobic conditions. In these different conditions, Thauera modifies its metabolism to produce different compounds that influence the microbial community. In particular, Thauera sp. MZ1T produces different exopolysaccharides with floc-forming properties, impacting the physical disposition of wastewater consortia and the efficiency of nutrient assimilation by the microbial community. Under N-limiting conditions, Thauera sp. MZ1T decreases its growth rate and accelerates the accumulation of polyhydroxyalkanoate-related (PHA) compounds including polyhydroxybutyrate (PHB), which plays a fundamental role as C and energy storage in this β-proteobacterium. However, the metabolic mechanisms employed by Thauera sp. MZ1T to assimilate and catabolize many of the different C and N sources under aerobic and anaerobic conditions remain unknown. Systems biology approaches such as genome-scale metabolic modeling have been successfully used to unveil complex metabolic mechanisms for various microorganisms. Here, we developed a comprehensive metabolic model (M-model) for Thauera sp. MZ1T (iThauera861), consisting of 1,744 metabolites, 2,384 reactions, and 861 genes. We validated the model experimentally using over 70 different C and N sources under both aerobic and anaerobic conditions. iThauera861 achieved a prediction accuracy of 95% for growth on various C and N sources and close to 85% for assimilation of aromatic compounds under denitrifying conditions. The M-model was subsequently deployed to determine the effects of substrates, oxygen presence, and the C:N ratio on the production of PHB and exopolysaccharides (EPS), showing the highest polymer yields are achieved with nucleotides and amino acids under aerobic conditions. This comprehensive M-model will help reveal the metabolic processes by which this ubiquitous species influences communities in wastewater treatment systems and natural environments.



Moscow.media
Частные объявления сегодня





Rss.plus




От метро «Купчино» до поселка Шушары в 2025 году поедут новые трамваи «Невский»

На памятнике локомотиву ЧС2-010 в Барабинске зажглись ходовые огни

Shazam. Увеличение прослушиваний в Shazam. 

Лидер российского рынка медицинского оборудования признан лучшим предпринимателем года


EuroMillions jackpot rolls over to £185,000,000 after no one claims ticket

Arsenal ‘pushing hardest’ for Julian Alvarez transfer but face battle with Premier League rivals for ex-Man City star

I had a bitter divorce with my ex-husband. I didn't expect his new wife to become one of my best friends years later.

This millennial CEO grew up with a heroin addict dad. Now he’s running a multimillion-dollar agency


Внедренческий центр «Раздолье» перевел «Интерпринт Рус» на 1С

Balkan Pharma Детройт

Европейцы плачут: Жить, как русские, им не по карману

Капитан полиции спас жилой дом от пожара в Орле


Metal Force 3.51.0

Five new Steam games you probably missed (May 26, 2025)

Игра Cultivation Chat Group заняла топ-7 в китайском App Store

Алмазы в Whiteout Survival: где собирать, как приумножать и на что тратить



IX Открытый Московский фестиваль конного искусства и спорта

В Рязани с успехом прошёл благотворительный концерт «Культура в помощь Донбассу»

В Тверской области прошёл благотворительный концерт «Культура в помощь Донбассу»

Наиль Гафуров: новые эпизоды в деле российского риэлтора-жулика




Ярославль: дачники в отдельном автобусе и три тонны опасного масла — главные новости за 28.05.2025

Новосибирское УФАС признало недобросовестными поставщиками сразу две компании

Собянин рассказал, каким будет новый пешеходный мост на остров Балчуг


Пробки на дорогах Подмосковья оценили в 7 баллов вечером 28 мая

Путин проведет встречу с многодетными семьями из девяти регионов

В Улан-Удэ на территории аэродрома поселились журавли-красавки

В Москве прошла церемония награждения победителей VII премии «PERSONO года»


«Возвращение в десятку — одна из задач» // Экс-девятая ракетка мира Вероника Кудерметова о задачах на сезон

Рафаэль Надаль подвел итоги своей карьеры на церемонии «Ролан Гаррос»

Елена Рыбакина сделала признание о работе со скандальным тренером

Арина Соболенко выходит во второй круг Открытого чемпионата Франции


Мужчина напал на игумена Евмения на презентации книги

Прихожане Владимирского храма посетили Донской монастырь в Москве

AP: Илон Маск покинет пост главы DOGE в администрации США

Тренд на ставки ниже. «Выберу.ру» составил рейтинг лучших ипотек на «вторичку» в мае 2025 года


Музыкальные новости

В Рязани с успехом прошёл благотворительный концерт «Культура в помощь Донбассу»

Шнуров и Розенбаум поздравили футбольный клуб «Зенит» со 100‑летним юбилеем

Малахов прокомментировал заявление Тимати о волшебной «воде с фтором»

Музыкальный бизнес Элджея приносит убытки



Наиль Гафуров: новые эпизоды в деле российского риэлтора-жулика

IX Открытый Московский фестиваль конного искусства и спорта

Выиграть миллион на «Юмор FM» помогает улыбка

Станислав Кондрашов о вызовах и возможностях цифровой власти технологических олигархов


Дочь певца Дениса Майданова начала активно гастролировать

Мерц пригрозил посодействовать лишению Словакии финансирования ЕС

В Рязани с успехом прошёл благотворительный концерт «Культура в помощь Донбассу»

Лучшие футболисты из Подмосковья в РПЛ: рейтинг и успехи


Собянин рассказал, каким будет новый пешеходный мост на остров Балчуг

В Москве выставили на продажу новый ВАЗ-2109 за 1,7 млн рублей

IX Открытый Московский фестиваль конного искусства и спорта

НПС модернизирует два участка трассы «Новороссия» в Ростовской области


Президент Лаоса извинился, что не смог приехать на День Победы в Москву

Путин попросил Собянина сделать транспорт доступным для инвалидов

Выиграть миллион на «Юмор FM» помогает улыбка

Президент Лаоса извинился перед Путиным за отсутствие на Дне Победы в Москве





Медики высоко оценили аппарат «Швабе» для ингаляционной анестезии

Большинство россиян выбирают врача по рекомендациям знакомых

Косметолог Мадина Осман: как сохранить молодость кожи в зоне декольте

ГК «ДИАКОН» представляет современные решения лабораторной диагностики на XI Международном конгрессе «Санаторно-курортное лечение» в Москве


Зеленский заявил, что в Киеве работают над получением ракет Taurus


«Сны Пушкина» – шоу вне жанров: вы действительно поверите в сказку

Поздравление с Днем Рождения Анатолию Корнеевичу Орлецкому

IX Открытый Московский фестиваль конного искусства и спорта

«Чемпионат»: Комличенко согласовал контракт с «Локомотивом»




Собянин рассказал, каким будет новый пешеходный мост на остров Балчуг

Путин попросил Собянина сделать транспорт доступным для инвалидов

Собянин: над Москвой и Подмосковьем отразили атаку трёх беспилотников

Собянин: Москва отбила атаку 33 вражеских дронов без потерь и ущерба


Олигархи и зелёные технологии - анализ Станислава Кондрашова

На рынке появилось технологичное агентство мобильного маркетинга mApps

Агроном предложил этим летом высадить на огороде экзотические культуры

«Турбозавры» подвели итоги творческого конкурса «Экозавр-25»


Мужчина напал на игумена Евмения на презентации книги

На западе Москвы приступили к устранению последствий атаки БПЛА

Таинственного «чужого» выловили в Охотском море: опубликованы пугающие фото

В Подмосковье решили выделить субсидии НПО на развитие гражданского общества


Как джин и виски из Саранска вывели предприятие Евгения Сидорова в лидеры индустрии

Жара накроет регионы России

Архангельские гребцы завоевали две медали на первенстве России в Краснодаре

В суд направлено уголовное дело о незаконной охоте с причинением крупного ущерба на территории Ненецкого автономного округа


Село Субботник частично останется без электричества: в Симферополе, Евпатории, Алуште, Ялте, Керчи, Джанкое, Феодосии и Севастополе отключат свет 29 мая 2025

Встреча друзей «Библиотека – волшебное место, где книгам не скучно, где всем интересно».

Выставка-призыв «Курение – зло, откажись от него»

Мы служим книге, чтобы книга служила людям


В Москве на «Авито» продают игрушку Лалубу за 100 тысяч рублей

AP: Илон Маск покинет пост главы DOGE в администрации США

Тренд на ставки ниже. «Выберу.ру» составил рейтинг лучших ипотек на «вторичку» в мае 2025 года

Яндекс добавили в сервис «Путешествия» ответы Алисы из «Поиска»












Спорт в России и мире

Новости спорта


Новости тенниса
Ролан Гаррос

Елена Рыбакина вышла в третий круг Открытого чемпионата Франции — 2025






Детский отдых в летнем сезоне 2025 года

В России возрождается интерес к библиотекам, уверена глава Минкультуры

Фонд «ЦИНИС» оказывает грантовую поддержку в сфере создания дирижаблей нового типа

СЕНСАЦИЯ! ЗАЧЕМ ДЕЛОМ ГРУППЫ ДЯТЛОВА ДЕЛАЛИ ГЕГЕМОНИЮ ДОЛЛАРА США. Новости про экспедицию, перевал Дятлова! Россия, США, Европа могут улучшить отношения и здоровье общества?!