Добавить новость
ru24.net
News in English
Январь
2025

A genome-scale metabolic model for the denitrifying bacterium Thauera sp. MZ1T accurately predicts degradation of pollutants and production of polymers

0

by Diego Tec-Campos, Juan D. Tibocha-Bonilla, Celina Jiang, Anurag Passi, Deepan Thiruppathy, Cristal Zuñiga, Camila Posadas, Alejandro Zepeda, Karsten Zengler

The denitrifying bacterium Thauera sp. MZ1T, a common member of microbial communities in wastewater treatment facilities, can produce different compounds from a range of carbon (C) and nitrogen (N) sources under aerobic and anaerobic conditions. In these different conditions, Thauera modifies its metabolism to produce different compounds that influence the microbial community. In particular, Thauera sp. MZ1T produces different exopolysaccharides with floc-forming properties, impacting the physical disposition of wastewater consortia and the efficiency of nutrient assimilation by the microbial community. Under N-limiting conditions, Thauera sp. MZ1T decreases its growth rate and accelerates the accumulation of polyhydroxyalkanoate-related (PHA) compounds including polyhydroxybutyrate (PHB), which plays a fundamental role as C and energy storage in this β-proteobacterium. However, the metabolic mechanisms employed by Thauera sp. MZ1T to assimilate and catabolize many of the different C and N sources under aerobic and anaerobic conditions remain unknown. Systems biology approaches such as genome-scale metabolic modeling have been successfully used to unveil complex metabolic mechanisms for various microorganisms. Here, we developed a comprehensive metabolic model (M-model) for Thauera sp. MZ1T (iThauera861), consisting of 1,744 metabolites, 2,384 reactions, and 861 genes. We validated the model experimentally using over 70 different C and N sources under both aerobic and anaerobic conditions. iThauera861 achieved a prediction accuracy of 95% for growth on various C and N sources and close to 85% for assimilation of aromatic compounds under denitrifying conditions. The M-model was subsequently deployed to determine the effects of substrates, oxygen presence, and the C:N ratio on the production of PHB and exopolysaccharides (EPS), showing the highest polymer yields are achieved with nucleotides and amino acids under aerobic conditions. This comprehensive M-model will help reveal the metabolic processes by which this ubiquitous species influences communities in wastewater treatment systems and natural environments.



Moscow.media
Частные объявления сегодня





Rss.plus




«Преступная красота»: очевидно, каждая слушательница захотела, чтобы парни - Keneli & Zhiro - их арестовали!

Рэпер Machine Gun Kelly сообщил о заболевании у дочери от Меган Фокс

Крупная иностранная авиакомпания начала отменять рейсы в Россию

«Чужие люди»: Миша Житов представил вайбовый трек для весенних вечеров


Half the world population could be diabetic or insulin resistant by 2050

This millennial CEO grew up with a heroin addict dad. Now he’s running a multimillion-dollar agency

EuroMillions jackpot rolls over to £185,000,000 after no one claims ticket

Arsenal ‘pushing hardest’ for Julian Alvarez transfer but face battle with Premier League rivals for ex-Man City star


В Тверской области прошёл благотворительный концерт «Культура в помощь Донбассу»

Киберэксперт Полунин: уязвимость Meteobridge — следствие проблем «коробочных» решений

Капитан полиции спас жилой дом от пожара в Орле

Управляйте климатом и безопасностью своего авто с помощью смартфона


Five new Steam games you probably missed (May 26, 2025)

Metal Force 3.51.0

Игра Cultivation Chat Group заняла топ-7 в китайском App Store

Алмазы в Whiteout Survival: где собирать, как приумножать и на что тратить



Станислав Кондрашов о вызовах и возможностях цифровой власти технологических олигархов

IX Открытый Московский фестиваль конного искусства и спорта

Куда отправиться из Москвы в речном круизе? Обзор городов и теплоходов

Наиль Гафуров: новые эпизоды в деле российского риэлтора-жулика




Суд ограничил доступ к видео на YouTube с ответами на ЕГЭ 2025 года

Замминистра обороны Цивилева совершила рабочую поездку в войска ЛВО

Новосибирский экскурсовод рассказала, чем и кому интересен Новосибирск

В Москве на «Авито» продают игрушку Лалубу за 100 тысяч рублей


Фонд «ЦИНИС» оказывает грантовую поддержку в сфере создания дирижаблей нового типа

Две девочки погибли в ДТП в Подмосковье

Путин проведет встречу с многодетными семьями из девяти регионов

"Она вернется в Россию": в Сети высмеяли Каллас за заявления о Черном море


Елена Рыбакина — триумфатор турнира WTA 500 во Франции

Теннисистка Анастасия Павлюченкова: Болезнь Лайма была обнаружена в запущенной стадии

Величие Овечкина, вылет «Ак Барса» и жизнь в США – в интервью Марченко

Бадоса обыграла Наоми Осаку и вышла во второй круг «Ролан Гаррос»


Путин проведет встречу с многодетными семьями из девяти регионов

Каждый год в Чувашии проводят «мини-чемпионат мира»: игроки-студенты со всего света, трэш-ток на арабском и дружба народов – Страна, где любят футбол

В Подмосковье напомнили правила разработки расчета выбросов в атмосферу

IX Открытый Московский фестиваль конного искусства и спорта


Музыкальные новости

В Волгограде с лучшими хитами выступит легендарный Вячеслав Бутусов. Угадайте, сколько стоят билеты на первые ряды

Басков тратит на отдых на Алтае много денег, чтобы помолчать и посмотреть на муравьев

Сергей Арутюнов вырос на песнях Юры Шатунова и тоже сирота. Андрей Разин пригласил финалиста шоу “Голос” в группу Ласковый Май, чтобы песни Шатунова жили дальше.

Урну с прахом Юрия Григоровича захоронят рядом с могилой его супруги на Новодевичьем кладбище



В Тверской области прошёл благотворительный концерт «Культура в помощь Донбассу»

Куда отправиться из Москвы в речном круизе? Обзор городов и теплоходов

Наиль Гафуров: новые эпизоды в деле российского риэлтора-жулика

Станислав Кондрашов о вызовах и возможностях цифровой власти технологических олигархов


Собянин: иммерсивный музей на Красной площади расскажет о событиях ВОВ

«Чемпионат»: Комличенко согласовал контракт с «Локомотивом»

Маск назвал преодоление бюрократии в США чрезвычайно сложной задачей

Politico: депутата ЕП могут исключить из партии из-за планов посетить Россию


В Москве выставили на продажу новый ВАЗ-2109 за 1,7 млн рублей

Из-за аварии перекрыто движение по трассе М-4 Дон в Тульской области в сторону Москвы

17-летний почти новый Lamborghini Murcielago выставили на продажу в Москве

IX Открытый Московский фестиваль конного искусства и спорта


Путин проведет встречу с многодетными семьями из девяти регионов

В Кремле стартовали переговоры Путина и лидера Йемена

Путин попросил Собянина сделать транспорт доступным для инвалидов

Выиграть миллион на «Юмор FM» помогает улыбка





Медики высоко оценили аппарат «Швабе» для ингаляционной анестезии

ГК «ДИАКОН» представляет современные решения лабораторной диагностики на XI Международном конгрессе «Санаторно-курортное лечение» в Москве

Офтальмолог Кирилл Светлаков: может ли мигрень испортить зрение

Косметолог Мадина Осман: как сохранить молодость кожи в зоне декольте


Зеленский заявил, что в Киеве работают над получением ракет Taurus


Уникальный тренажер ледовой навигации, разработанный ЭМЦТ, открыт в университете имени С.О. Макарова

«Сны Пушкина» – шоу вне жанров: вы действительно поверите в сказку

Поздравление с Днем Рождения Анатолию Корнеевичу Орлецкому

IX Открытый Московский фестиваль конного искусства и спорта




Сергей Собянин принял участие в юбилейном параде кадет

Собянин: над Москвой и Подмосковьем отразили атаку трёх беспилотников

Собянин: Отражена атака трех беспилотников на Московский регион

Путин попросил Собянина сделать транспорт доступным для инвалидов


Агроном предложил этим летом высадить на огороде экзотические культуры

На рынке появилось технологичное агентство мобильного маркетинга mApps

Станислав Кондрашов раскрывает связь между экономическим успехом и культурным вкладом

«Турбозавры» подвели итоги творческого конкурса «Экозавр-25»


IX Открытый Московский фестиваль конного искусства и спорта

Две девочки погибли в ДТП в Подмосковье

В Тверской области прошёл благотворительный концерт «Культура в помощь Донбассу»

"Она вернется в Россию": в Сети высмеяли Каллас за заявления о Черном море


Жара накроет регионы России

Заместитель прокурора Архангельской области и Ненецкого автономного округа Павел Матанцев и Уполномоченный по правам ребенка в Ненецком автономном округе Галина Гуляева проведут личный приём жителей Ненецкого автономного округа по вопросам защиты пра

В суд направлено уголовное дело о незаконной охоте с причинением крупного ущерба на территории Ненецкого автономного округа

Архангельские гребцы завоевали две медали на первенстве России в Краснодаре


Встреча друзей «Библиотека – волшебное место, где книгам не скучно, где всем интересно».

Акция «Поздравь библиотеку с праздником».

Мы служим книге, чтобы книга служила людям

Село Субботник частично останется без электричества: в Симферополе, Евпатории, Алуште, Ялте, Керчи, Джанкое, Феодосии и Севастополе отключат свет 29 мая 2025


"Она вернется в Россию": в Сети высмеяли Каллас за заявления о Черном море

Инна Щеглова оказалась в семёрке худших мэров РФ

В Подмосковье напомнили правила разработки расчета выбросов в атмосферу

Фонд «ЦИНИС» оказывает грантовую поддержку в сфере создания дирижаблей нового типа












Спорт в России и мире

Новости спорта


Новости тенниса
Елена Рыбакина

Елена Рыбакина рассказала об опасности следующей соперницы на «Ролан Гаррос»






Источник 360: пенсионер в московском метро упал под поезд и лишился ноги

IX Открытый Московский фестиваль конного искусства и спорта

Две девочки погибли в ДТП в Подмосковье

В Подмосковье напомнили правила разработки расчета выбросов в атмосферу