El Real Betis ha tanteado la opción en incorporar a Juanito a su equipo de trabajo en la dirección deportiva . Es un candidato con experiencia en los despachos y en el césped, algo muy importante. Su gestión en el Córdoba , club con el que ha logrado el ascenso a LaLiga Hypermotion (Segunda división), ha llamado la atención del club verdiblanco. Tras la marcha del exdirector deportivo Ramón Planes a Arabia Saudí, se han generado movimientos en la estructura de la organización verdiblanca. Con Manu Fajardo al frente, acompañado de Miguel Calzado y Álvaro Ladrón de Guevara , el club ahora estudia la posibilidad de incorporar a Juanito tal y como ha señalado Canal Sur Radio . Además, Juanito cuenta con un vínculo especial con la entidad . Conoce bien al Betis donde fue canterano. Es el equipo con el que jugó durante ocho temporadas (un total de 289 partidos) y conquistó la Copa del Rey en el año 2005. Tras su retiro, regresó como técnico de las categorías inferiores (Juvenil A y Betis Deportivo entre los años 2021 y 2014). A pesar del interés del Betis, Juanito tiene contrato con el Córdoba que se prolonga hasta 2026 , lo que supone por ahora un obstáculo. Sin embargo, en El Arcángel temen que la propuesta verdiblanca sea demasiado atractiva para él, dadas sus raíces en el club.
