Ученые ТПУ и Германии создали общедоступное ПО для биомедицины

Сотрудники Томского политехнического университета (ТПУ) и Технологического института Карлсруэ (Германия) разработали программное обеспечение, анализирующее скаффолды, – полимерную основу для выращивания новых органов и тканей; это первое общедоступное ПО для исследования полимерных и гибридных материалов, сообщила во вторник пресс-служба вуза

ТОМСК, 13 авг – РИА Томск. Сотрудники Томского политехнического университета (ТПУ) и Технологического института Карлсруэ (Германия) разработали программное обеспечение, анализирующее скаффолды, – полимерную основу для выращивания новых органов и тканей; это первое общедоступное ПО для исследования полимерных и гибридных материалов, сообщила во вторник пресс-служба вуза. По информации вуза, скаффолды – перспективное направление в биомедицине. Они представляют собой материалы из тонких полимерных нитей, переплетенных между собой. Их размещают в месте костного дефекта, например, перелома, в качестве каркаса для новых костных клеток. Новая костная ткань прорастает сквозь скаффолд и заполняет место перелома. Когда кость полностью восстанавливается, полимер растворяется в организме. "ПО Quanfima анализирует структуру полимерных каркасов, которые служат основой для выращивания новых органов и тканей. В отличие от существующих аналогов, это первое общедоступное ПО, которое анализирует разные виды биоматериалов: полимерные скаффолды или гибридные полимерные скаффолды, в составе которых находится микродисперсная неорганическая фаза", – говорится в сообщении. По словам одного из авторов исследования, директора научно-исследовательского центра "Физическое материаловедение и композитные материалы" ТПУ Романа Сурменева, композитные трехмерные скаффолды, представленные различными материалами с волокнистой структурой или содержащие различные добавки, оказывают положительный эффект на процессы регенерации различных тканей. Необходимость разработки ПО, по данным политехников, объясняется отсутствием бесплатного программного продукта для анализа волокон с точки зрения их ориентации в пространстве относительно выбранного базиса и размера. "У ряда зарубежных научных групп есть коммерческие продукты, чей функционал схож с разработанной нами программой, однако они не находятся в открытом доступе", – цитируется в сообщении ученый. Международный тандем Как сообщает вуз, работа велась в составе международной научной группы. Создавал ПО на основе языка программирования Python сотрудник Технологического института Карлсруэ Роман Шкарин. Политехники в свою очередь предоставили модельные материалы для исследований – полимерный скаффолд и гибридный полимерный скаффолд. Программный пакет Quanfima, по словам разработчиков, основан на нескольких широко распространенных продуктах, разработанных для анализа данных, например, NumPy, SciPy, scikit-image, VIGRA, Pandas и Statsmodels. В новом ПО ученые постарались объединить их возможности. "В настоящее время ПО Quanfima ("Quantitative Analysis of Fibrous Materials") разработано и может быть использовано по назначению. Продукт можно скачать по ссылке. Наша программа позволяет анализировать параметры, которые являются ключевыми для любого биоматериала при использовании в регенеративной медицине", – резюмировал Сурменев