Melanoma progression and prognostic models drawn from single-cell, spatial maps of benign and malignant tumors | Science Advances
Spatial analysis of melanoma microenvironment gene expression at single-cell level identifies markers of malignancy and prognosis.
Abstract
Melanoma clinical outcomes emerge from incompletely understood genetic mechanisms operating within the tumor and its microenvironment. Here, we used single-cell RNA-based spatial molecular imaging (RNA-SMI) in patient-derived archival tumors to reveal clinically relevant markers of malignancy progression and prognosis. We examined spatial gene expression of 203,472 cells inside benign and malignant melanocytic neoplasms, including melanocytic nevi and primary invasive and metastatic melanomas. Algorithmic cell clustering paired with intratumoral comparative two-dimensional analyses visualized synergistic, spatial gene signatures linking cellular proliferation, metabolism, and malignancy, validated by protein expression. Metastatic niches included up-regulation of
CDK2
and
FABP5
, which independently predicted poor clinical outcome in 473 patients with melanoma via Cox regression analysis. More generally, our work demonstrates a framework for applying single-cell RNA-SMI technology toward identifying gene regulatory landscapes pertinent to cancer progression and patient survival.
Moscow.media
Частные объявления сегодня
Филиал № 4 ОСФР по Москве и Московской области информирует:
2,5 млн жителей Москвы и Московской области получили пособия по временной нетрудоспособности с начала 2024 года
Филиал № 4 ОСФР по Москве и Московской области информирует:
Пенсии работающих пенсионеров начнут индексироваться с 2025 года
Росгвардейцы устроили участникам летнего лагеря настоящий урок мужества
Филиал № 4 ОСФР по Москве и Московской области информирует:
Более 12 тысяч жителей Москвы и Московской области получают повышенную пенсию за работу в сельском хозяйстве
Карточка Артиста. Карточка артиста яндекс.
8 опасных насекомых и членистоногих, с которыми лучше не сталкиваться
Выбросить и забыть: какая обувь портит ваш образ
В первом полугодии 2024 года в сервисных локомотивных депо филиала «Северный» ООО «ЛокоТех-Сервис» прошли производственную практику 460 студентов
India face first defeat in hockey at Paris Olympics against Belgium
Rewards Drive Mobile Wallet Use for One-Third of eCommerce Shoppers
Best UFC Fight Night Betting Promos & Bonuses | Grab $4500+ for Sandhagen-Nurmagomedov Odds
Top Heavyweight Tells Deontay Wilder To ‘Stay On The Couch’ After Shock World Title Fight Offer
Вид на Борисоглебский монастырь перед грозой
НПО СтарЛайн показало на выставке «Мой Петербург» беспилотный тягач StarLine
Филиал № 4 ОСФР по Москве и Московской области информирует:
Пенсии работающих пенсионеров начнут индексироваться с 2025 года
Врач объяснил пути заражения ротавирусом на курорте: море ни при чём
Началась предзагрузка Sword of Convallaria на iOS и Android
Don't expect Dragon Age: The Veilguard before October at the absolute earliest
Former GTA dev says 'it's time for a revolution' where 'animation is more AI-driven and physics-driven' than done by hand
THQ Nordic анонсировал Wreckfest 2 на PC и консоли
Послуга перевезення кота, собаки або іншої тварини за кордон - Delivery Animal
Міжнародна академія PROeffect Academy запрошує
Сводный оркестр Росгвардии исполнил знаменитые произведения в парке Москвы
Обращение иерея Александра Туховского
Росгвардейцы устроили участникам летнего лагеря настоящий урок мужества
Алексей Фомин представил миру новый трек «Лунный свет»
США пообещали санкции против РФ за «неправомерное удержание американцев»
Филиал № 4 ОСФР по Москве и Московской области информирует:
Пенсии работающих пенсионеров начнут индексироваться с 2025 года
Трассу М-4 «Дон» в Воронежской области зальют дожди
Филиал № 4 ОСФР по Москве и Московской области информирует:
Более 12 тысяч жителей Москвы и Московской области получают повышенную пенсию за работу в сельском хозяйстве
Движение поездов на Люблинско-Дмитровской линии метро в Москве ввели в график
В Минобрнауки рассказали о предварительных итогах приёмной кампании в вузы
Парковке нашли место и тариф // В столице с 5 августа расширили зону платного паркинга
Сотрудница МВД в Мариинске сбила насмерть велосипедиста и попала на видео
Касаткина проиграла Доулхайд на турнире WTA в Вашингтоне
Российский теннисист Рублев не смог выйти в финал турнира в Вашингтоне
У России будет медаль на Олимпиаде в Париже
Джокович поделился эмоциями от первого выхода в финал Олимпиады
Сотрудница МВД в Мариинске сбила насмерть велосипедиста и попала на видео
ВС РФ применили новую тактику для уничтожения нефтебазы под Винницей
Медведев: Обмен заключенными между Россией и Западом состоялся «в нашу пользу»
Ефимов: два участка в Гагаринском районе Москвы реорганизуют по программе КРТ
Музыкальные новости
Продать стихи. Как продать стихи. Продать стихи собственного сочинения.
Байден не будет раскрывать усилий по переговорам об осужденном в России Фогеле
Беременная Карди Би публично защитила Оффсета, с которым разводится: «Он очень мне помогает»
Тайные концерты Пугачёвой: Совет Инстасамки сработал на Алле. Певица заработала 18,5 миллионов рублей
Росгвардейцы устроили участникам летнего лагеря настоящий урок мужества
Обращение иерея Александра Туховского
Алексей Фомин представил миру новый трек «Лунный свет»
Застройщик «ЛенСтройГрад» объявил о старте продаж в новом корпусе квартала «Счастье 2.0»
Что там в IT: смерть YouTube в России, падение Intel и GPT-поиск от OpenAI
Обращение иерея Александра Туховского
Путин: Россия создаст бесшовное ж/д сообщение от Балтики до Индийского океана
Брат обвиняемого в подрыве авто Серебрякова рассказал, как он попадал в Польшу
«Нет никакого желания его навещать»: брат Серебрякова не будет с ним общаться
Очень красивая история получилась из нашумевшего «исторического» обмена, состоявшегося на днях
Наговорил на три "самые тяжкие" статьи УК: После подрыва машины военного в Москве брат диверсанта вскрыл позорный факт
В Москве буйный водитель снес две остановки, на которых находились люди
Ким Чен Ын не исключил обращения к Москве за помощью из-за наводнения
Был в шоке и чуть в обморок не упал – обмененный Роман Селезнев рассказал о встрече с Путиным
Главный нарколог Москвы Масякин рассказал, кому больше всего вреден алкоголь
Нарколог Масякин заявил, что алкоголь особенно вреден для пожилых людей
Аналитприбор монооксида углерода выдыхаемого воздуха - в списке оснащения кабинетов врачей
Нарколог рассказал, кому больше всего вреден алкоголь
Премьер-лига. ЦСКА - "Оренбург" - 5:1.
Вышел сериал Евгения Стычкина "Игры" о проведении Олимпиады-80 в Москве
ЦСКА и "Оренбург" объявили составы на матч третьего тура РПЛ
Ставропольский «Виктор» завоевал бронзу Кубка России по пляжному гандболу
Собянин: Миллион человек посетили около 100 мероприятий в рамках 85-летия ВДНХ
Сергей Собянин. Главное за день
Собянин: Более 100 тысяч москвичей выбрали карьеру с «Профессиями будущего»
Собянин: трамвайному депо им. Апакова – 115 лет
КНДР при необходимости обратится к Москве из-за наводнения — Ким Чен Ын
Позвольте вашу лапку, Барышня: истории самых известных тигров, которые полюбились москвичам
В Москве показали прототип нового российского электромобиля "Молния"
Ким Чен Ын не исключил обращения к Москве за помощью из-за наводнения
Парковке нашли место и тариф // В столице с 5 августа расширили зону платного паркинга
«Локомотив» назвал стартовый состав на матч с «Ахматом»
Медведев: Обмен заключенными между Россией и Западом состоялся «в нашу пользу»
Baidu: ответ Путина и КНР на полет B-52 над Баренцевым морем вызвал панику в США
Пропавшую под Архангельском двухлетнюю девочку нашли живой в болоте
Огонь чудом не перекинулся на дома: последствия сильного пожара в Архангельске
Из столицы Поморья в Белоруссию стартовал автопробег активистов поискового движения
Премьера пространственной симфонии состоялась в Архангельской области
Выставка-юбилей
«Поговорим о человечности»,
к 100-летию со дня рождения А.Г. Алексина,
писателя, сценариста и драматурга.
Цена квадратного метра в Севастополе упала, в Симферополе держится
В путь-дорогу: подборка полезных мобильных приложений для водителей
Выставка-приглашение «Лето книжного цвета: новые книги в библиотеке!»
Крупный пожар произошел в промзоне Азова Ростовской области
В Минобрнауки рассказали о предварительных итогах приёмной кампании в вузы
Сотрудница МВД в Мариинске сбила насмерть велосипедиста и попала на видео
Кирби: США введут новые санкции против России за удержание американцев