Gene regulation is essential to placental function and fetal development. We built a genome-scale transcriptional regulatory network (TRN) of the human placenta using digital genomic footprinting and transcriptomic data. We integrated 475 transcriptomes and 12 DNase hypersensitivity datasets from placental samples to globally and quantitatively map transcription factor (TF)–target gene interactions. In an independent dataset, the TRN model predicted target gene expression with an out-of-sample
R
2
greater than 0.25 for 73% of target genes. We performed siRNA knockdowns of four TFs and achieved concordance between the predicted gene targets in our TRN and differences in expression of knockdowns with an accuracy of >0.7 for three of the four TFs. Our final model contained 113,158 interactions across 391 TFs and 7712 target genes and is publicly available. We identified 29 TFs which were significantly enriched as regulators for genes previously associated with preterm birth, and eight of these TFs were decreased in preterm placentas.
Грузия предложила России перейти к действенным шагам по улучшению отношений с Абхазией и Южной Осетией
Мытищинские юнармейцы побывали в Санкт-Петербурге
Жилой комплекс загорелся на севере Москвы
СЕНСАЦИЯ: НАЙДЕНЫ ОСНОВАНИЯ РОССИИ НА ЯДЕРНОЕ ОРУДИЕ! НАТО ЗНАЧИТ НАДО? Полезные советы Высшего Всенародного Президента Вселенной. Россия, США, Европа могут улучшить отношения?!
Срок по кредиту // Бывшие управленцы банка осуждены как растратчики
Самолет заглох во время рулежки к взлетной полосе в аэропорту Внуково
СЕНСАЦИЯ: НАЙДЕНЫ ОСНОВАНИЯ РОССИИ НА ЯДЕРНОЕ ОРУДИЕ! НАТО ЗНАЧИТ НАДО? Полезные советы Высшего Всенародного Президента Вселенной. Россия, США, Европа могут улучшить отношения?!
ЯДЕРНЫМ ОРУДИЕМ НЕ РАЗБРАСЫВАЮТСЯ, НО ЕСЛИ НАТО, ЗНАЧИТ НАДО?! "ДОБРЫЙ КАРДИНАЛ КРЕМЛЯ". Полезные советы Высшего Всенародного Президента Вселенной. Важные данные для России, Европы, США и всего мира!