Специалистами расшифрованы геномы лекарственного василисника

Группа ученых из научно-исследовательской лаборатории «Гербарий» Томского государственного университета (ТГУ) совместно с коллегами из Китая опубликовали результаты изучения растений рода василисник (Thalictrum), обладающих антибактериальными и другими фармацевтическими свойствами. Об этом сообщает пресс–центр ТГУ.

Род василисник (Thalictrum) – один из крупных родов семейства лютиковые, насчитывающий более 200 видов. Лекарственные растения богаты алкалоидными производными бензилизохинолина, большинство из которых биологически активны и применяются в народной медицине, а также в традиционной китайской медицине (ТКМ) для лечения энтерита и дизентерии.

«Секвенирование следующего поколения (next-generation sequencing) привело к созданию огромного количества данных о геномах растений, протеомах, транскриптомах и многом другом. Вычислительные инструменты для извлечения смысла из этих огромных наборов данных предлагает быстро развивающаяся область ботаники – биоинформатика растений. Мы использовали технологии биоинформатики для изучения рода василисник», – рассказывает Андрей Эрст, старший научный сотрудник «Гербария» ТГУ и соавтор статьи.

Лекарственные препараты на основе василисников обладают антибактериальным, противоопухолевым, общеукрепляющим, мочегонным, слабительным и ранозаживляющим действием. Некоторые виды использовались в качестве гипотензивного средства. Также василистники накапливают литий, играющий важную роль в регулировании нервной системы.

Китайско-российская группа ученых проанализировала селективное давление и систематическую ошибку использования кодонов всех хлоропластных генов для 11 видов василисника. Выяснилось, что род Thalictrum является монофилетическим (т.е. происходит от общего предка) и, согласно пластомам, делится на две основные клады. Доступность опубликованных данных о пластомах василисника позволит точно идентифицировать виды и ответить на сложные вопросы в области таксономии, филогении и эволюционной биологии василисников.

Работа ученых «Организация, использование филогенетических маркеров и эволюция генов в пластоме Thalictrum (Ranunculaceae)» опубликована в журнале «Frontiers in Plant Science». В работе приведены и с помощью технологий биоинформатики проанализированы полные пластидные геномы (пластомы) двух видов василисников – малого (T. minus var. hypoleucum) и простого (T. simplex).

Фото Pixabay