GENERALIST: A latent space based generative model for protein sequence families
by Hoda Akl, Brooke Emison, Xiaochuan Zhao, Arup Mondal, Alberto Perez, Purushottam D. Dixit
Generative models of protein sequence families are an important tool in the repertoire of protein scientists and engineers alike. However, state-of-the-art generative approaches face inference, accuracy, and overfitting- related obstacles when modeling moderately sized to large proteins and/or protein families with low sequence coverage. Here, we present a simple to learn, tunable, and accurate generative model, GENERALIST:
GENERAtive nonLInear tenSor-factorizaTion for protein sequences. GENERALIST accurately captures several high order summary statistics of amino acid covariation. GENERALIST also predicts conservative local optimal sequences which are likely to fold in stable 3D structure. Importantly, unlike current methods, the density of sequences in GENERALIST-modeled sequence ensembles closely resembles the corresponding natural ensembles. Finally, GENERALIST embeds protein sequences in an informative latent space. GENERALIST will be an important tool to study protein sequence variability.
Moscow.media
Частные объявления сегодня
Токсиколог Кутушов назвал привычку ставить много будильников опасной для здоровья
Филиал № 4 ОСФР по Москве и Московской области напоминает:
В Московском регионе 11,4 тысячи пап находятся в отпуске по уходу за ребенком
Грибная охота: токсиколог Кутушов рассказал, как избежать отравления и собирать только безопасные грибы
Свыше 6,5 тысячи жителей Москвы и Московской области получили справки о статусе предпенсионера в клиентских службах регионального Отделения СФР и МФЦ
Какая река самая широкая в России, и где она находится
«Мы не могли нормально работать»: как Азербайджан препятствовал оказанию помощи Красного Креста во время блокады Нагорного Карабаха. Фоторяд
Бурятский театр оперы и балета торжественно открыл юбилейный сезон
Грибная охота: токсиколог Кутушов рассказал, как избежать отравления и собирать только безопасные грибы
‘We’ll be woken up at 4am every DAY’ slam locals over £200m expansion of major UK airport… but some can’t wait
Crew of doomed Bayesian superyacht say they ‘saved who they could’
Snell shines, Chapman plays hero as SF Giants rally for needed win
Heartbreaking moment Brit certain for Paralympics 2024 gold suddenly crashes and collapses onto velodrome floor
Шоу-кар в ретро-стиле Hyundai N Vision 74 отправится в серийное производство
Мобильный принтер этикеток iMove T3Pro - лёгкий, производительный, компактный
Мигранты захватывают Новосибирск: Русских заставляют учить киргизский
Заместитель управляющего ОСФР по г. Москве и Московской области Алексей Путин об индексации работающим пенсионерам
Risk of Rain 2 creators weigh in on Gearbox's first DLC without them: 'It's great to see new content for the game, but it's hard to see growing pains of the new team in real time'
1 млн предрегистраций на Nigoriri Angels on Stage и релиз на этой неделе
Asus ROG Zephyrus G16 (2024) GA605 review
The PC game releases we're most excited about in September
Як встановити ручки на планці для дверей
Як вибрати накладний замок
ТАСС: задержанного за взятку генерала Муминджанова отправили в Москву
Филиал № 4 ОСФР по Москве и Московской области напоминает:
В Московском регионе 11,4 тысячи пап находятся в отпуске по уходу за ребенком
Заместитель управляющего ОСФР по г. Москве и Московской области Алексей Путин об индексации работающим пенсионерам
Филиал № 4 ОСФР по Москве и Московской области информирует:
В Московском регионе 11,4 тысячи пап находятся в отпуске по уходу за ребенком
Аналитик Васильев: доллар до конца года будет стоить около 90 рублей
Филиал № 4 ОСФР по Москве и Московской области напоминает:
В Московском регионе 11,4 тысячи пап находятся в отпуске по уходу за ребенком
"Яндекс Аренда": средняя ставка аренды жилья в России за месяц выросла на 12%
Грибная охота: токсиколог Кутушов рассказал, как избежать отравления и собирать только безопасные грибы
Антонов сообщил об отказе США выдавать визы учителям при посольстве РФ
В Москве возбудили уголовное дело по факту контрабанды тонны прекурсоров для изготовления наркотиков
"Надо пополнить фонд класса": Поборы на ремонт в школах удивили родителей
Жительница Ленобласти угнала машину в Москве
Теннисистка Петрова: Медведев показал класс в третьем круге US Open
Серена Уильямс ответила, планирует ли возвращаться в WTA-тур
Теннисист Медведев прошел в третий круг US Open в Нью-Йорке
Теннисист Рублев проиграл Димитрову в матче четвертого круга US Open
ПКР поздравляет Зою Щурову с завоеванием серебряной медали на XVII Паралимпийских летних играх в Париже
Названа самая опасная улица в Москве для водителей
Главные новости за 02 сентября, Нижний Новгород: Буйный пациент напал на анестезиолога, ночью сгорели 5 грузовиков и другие
"Надо пополнить фонд класса": Поборы на ремонт в школах удивили родителей
Музыкальные новости
Гарик Burito: «Рок-музыка – это моя опора»
Бывший Кубанский Мариинский женский институт отметит 115-летие
Жена Макаревича рассказала, что усложняет ей общение с детьми мужа от предыдущих отношений
Жена Джигана заявила, что потратила 20 тысяч на школьную форму для детей
ТАСС: задержанного за взятку генерала Муминджанова отправили в Москву
Филиал № 4 ОСФР по Москве и Московской области напоминает:
В Московском регионе 11,4 тысячи пап находятся в отпуске по уходу за ребенком
Филиал № 4 ОСФР по Москве и Московской области информирует:
В Московском регионе 11,4 тысячи пап находятся в отпуске по уходу за ребенком
Радио привлекает внимание к социальным темам и меняет мир
Какая река самая широкая в России, и где она находится
«Яндекс Путешествия»: Владивосток вошел в топ-5 направлений для отпуска в бархатный сезон
«История решена с любовью и юмором»: на ТНТ выходит продолжение сериала «Просто Михалыч» с Владимиром Епифанцевым, Ольгой Медынич и Екатериной Климовой
Еще один направлявшийся к Москве БПЛА сбит ПВО — Собянин
Ежегодный фестиваль технических видов спорта пройдет в Москве в День города
Жительница Ленобласти угнала машину в Москве
Сын генерала Муминджанова оказался владельцем BMW и квартиры в элитном ЖК Москвы
В КХЛ может появиться новый клуб из Москвы, России нашли замену на ОИ. Итоги дня в хоккее
Эксперт: В Монголии Москве интересны модернизация ТЭС и проект «Союз Восток»
Заместитель управляющего ОСФР по г. Москве и Московской области Алексей Путин об индексации работающим пенсионерам
Путин назвал развитие связей с Монголией одним из приоритетов РФ
Путин: Россия готова обеспечить Монголию топливом и ГСМ по льготным ценам
В госпитальной школе подмосковного онкодиспансера прозвенел первый звонок
Педиатр Константинова: пример семьи имеет большое значение в борьбе с ожирением у детей
Суд арестовал курьера, пытавшегося изнасиловать девушку-инвалида в Москве
Собянин назвал лично лекарств, произведенных по офсетным контрактам
Губернатор Орловской области Андрей Клычков встретился со студентам Мезенского педколледжа
Экс-футболист сборной России: «В Москве из-за невероятных пробок на день невозможно запланировать несколько дел»
Дмитрий Черышев: Денис не завершил карьеру и ведёт переговоры с клубами
Новый персонаж сериала «Команда МАТЧ» Шоня стал талисманом «Матч ТВ»
"Если попробуют более жёстко, погибнет вся планета": Лукашенко предупредил США
Лукашенко советует молодежи в регионах не стремиться в Минск
Собянин открыл школу на юго-западе Москвы после реконструкции
Сергей Собянин. Главное за день
Собянин назвал лично лекарств, произведенных по офсетным контрактам
Собянин: Более 2,4 млн упаковок лекарств получил город по офсетным контрактам
Синоптик Ильин: аномальная жара в Москве связана с антициклоном
Около 49 тысяч человек посетили Московский Медиафестиваль
Систему городского транспорта Москвы предложено дополнить малогабаритными электромобилями
В воскресенье еще потеплеет: с чем связана аномальная жара в Москве в сентябре
Телеведущий Тихомиров рассказал о лучшем времени для сбора грибов в Подмосковье
ПКР поздравляет Зою Щурову с завоеванием серебряной медали на XVII Паралимпийских летних играх в Париже
"Надо пополнить фонд класса": Поборы на ремонт в школах удивили родителей
Главные новости за 02 сентября, Нижний Новгород: Буйный пациент напал на анестезиолога, ночью сгорели 5 грузовиков и другие
Ревнивый муж залил зеленкой бывшего мэра Архангельска на съемках фильма
Снайперы из Пскова научились поражать цели на сверхдальних расстояниях
Архангельские работодатели жалуются на старение населения в регионе
Близкая Арктика: что посмотреть в Архангельской области
1 и 2 сентября филиал РТРС «РТПЦ Республики Мордовия» и Министерство образования Республики Мордовия проведут совместную акцию, приуроченную ко Дню знаний и началу нового учебного года.
Встреча друзей «Храм науки, мечтаний, чудес»
Выставка крымского имени «Тайны души и творчества Алемдара Караманова»
Книжная выставка-реквием "В служении верном Отчизне клянусь!"
Россиянка лишилась пальца из-за обручального кольца
СЕНСАЦИЯ В ЯДЕРНОМ ОРУДИИ: "ПОСЕЙДОН РЭМЫЧ". ДОПОЛНИТЕЛЬНАЯ ТЕХНОЛОГИЯ. Очень важные данные для России и всего мира!
"Надо пополнить фонд класса": Поборы на ремонт в школах удивили родителей
Автоэксперт Попов опроверг данные о 500 тысячах за перенастройку дорожной камеры