Transfer learning with false negative control improves polygenic risk prediction
by Xinge Jessie Jeng, Yifei Hu, Vaishnavi Venkat, Tzu-Pin Lu, Jung-Ying Tzeng
Polygenic risk score (PRS) is a quantity that aggregates the effects of variants across the genome and estimates an individual’s genetic predisposition for a given trait. PRS analysis typically contains two input data sets: base data for effect size estimation and target data for individual-level prediction. Given the availability of large-scale base data, it becomes more common that the ancestral background of base and target data do not perfectly match. In this paper, we treat the GWAS summary information obtained in the base data as knowledge learned from a pre-trained model, and adopt a transfer learning framework to effectively leverage the knowledge learned from the base data that may or may not have similar ancestral background as the target samples to build prediction models for target individuals. Our proposed transfer learning framework consists of two main steps: (1) conducting false negative control (FNC) marginal screening to extract useful knowledge from the base data; and (2) performing joint model training to integrate the knowledge extracted from base data with the target training data for accurate trans-data prediction. This new approach can significantly enhance the computational and statistical efficiency of joint-model training, alleviate over-fitting, and facilitate more accurate trans-data prediction when heterogeneity level between target and base data sets is small or high.
Новости России
Москва
Филиал № 4 ОСФР по Москве и Московской области информирует:
В Московском регионе 11,4 тысячи пап находятся в отпуске по уходу за ребенком
Moscow.media
Частные объявления сегодня
Свыше 6,5 тысячи жителей Москвы и Московской области получили справки о статусе предпенсионера в клиентских службах регионального Отделения СФР и МФЦ
Токсиколог Кутушов назвал привычку ставить много будильников опасной для здоровья
Заместитель управляющего ОСФР по г. Москве и Московской области Алексей Путин об индексации работающим пенсионерам
Филиал № 4 ОСФР по Москве и Московской области напоминает:
В Московском регионе 11,4 тысячи пап находятся в отпуске по уходу за ребенком
«Странные странности» из интервью российского историка – мой ответ армянину, «не помнящему» своего армянства…
Какие трикотажные изделия будут в моде этой осенью
Представители филиала «Северный» ООО «ЛокоТех-Сервис» поздравили студентов профильных учебных заведений с Днём знаний
Snell shines, Chapman plays hero as SF Giants rally for needed win
Heartbreaking moment Brit certain for Paralympics 2024 gold suddenly crashes and collapses onto velodrome floor
Crew of doomed Bayesian superyacht say they ‘saved who they could’
League One side Birmingham make £10m bid for Premier League striker that will shatter division’s transfer record
ЗА ГРАНИЦУ С ЧИСТЫМ ЗОЛОТОМ
В ночь на 3 сентября перекроют путепровод у Гусиного брода в Новосибирской области
Пять жилых домов и два бомбоубежища снесут в Екатеринбурге в рамках КРТ
Дедушка Мороз, ты подарки нам принес? 1.22.1
1 млн предрегистраций на Nigoriri Angels on Stage и релиз на этой неделе
The PC game releases we're most excited about in September
Asus ROG Zephyrus G16 (2024) GA605 review
Як вибрати накладний замок
Як встановити ручки на планці для дверей
ТАСС: задержанного за взятку генерала Муминджанова отправили в Москву
Филиал № 4 ОСФР по Москве и Московской области информирует:
В Московском регионе 11,4 тысячи пап находятся в отпуске по уходу за ребенком
Заместитель управляющего ОСФР по г. Москве и Московской области Алексей Путин об индексации работающим пенсионерам
Радио привлекает внимание к социальным темам и меняет мир
Токсиколог Кутушов назвал привычку ставить много будильников опасной для здоровья
"Яндекс Аренда": средняя ставка аренды жилья в России за месяц выросла на 12%
Филиал № 4 ОСФР по Москве и Московской области напоминает:
В Московском регионе 11,4 тысячи пап находятся в отпуске по уходу за ребенком
Metaratings: «Динамо» интересуется Тикнизяном
Антонов сообщил об отказе США выдавать визы учителям при посольстве РФ
Главные новости за 02 сентября, Нижний Новгород: Буйный пациент напал на анестезиолога, ночью сгорели 5 грузовиков и другие
Жительница Ленобласти угнала машину в Москве
В Москве возбудили уголовное дело по факту контрабанды тонны прекурсоров для изготовления наркотиков
Теннисист Медведев прошел в третий круг US Open в Нью-Йорке
Джокович проиграл в третьем круге US Open и впервые с 2017 года завершит год без титула на турнире Большого шлема
Серена Уильямс ответила, планирует ли возвращаться в WTA-тур
Теннисист Медведев обыграл Боржеша и вышел в 1/4 финала US Open
РЖД: новая ВСМ позволит добраться от Москвы до Санкт-Петербурга за 2 часа
Подозреваемых в тройном убийстве задержали под Вологдой
ПКР поздравляет Зою Щурову с завоеванием серебряной медали на XVII Паралимпийских летних играх в Париже
Главные новости за 02 сентября, Нижний Новгород: Буйный пациент напал на анестезиолога, ночью сгорели 5 грузовиков и другие
Музыкальные новости
В Сочи подвели итоги конкурса национальной патриотической песни «Красная гвоздика» имени Иосифа Давыдовича Кобзона
Композиции Исаака Дунаевского, Булата Окуджавы и стихи Роберта Рождественского прозвучат на театрализованном вечере «Линии жизни» в Мариинском театре
Жена Макаревича рассказала, что усложняет ей общение с детьми мужа от предыдущих отношений
Филиал № 4 ОСФР по Москве и Московской области информирует:
В Московском регионе 11,4 тысячи пап находятся в отпуске по уходу за ребенком
Радио привлекает внимание к социальным темам и меняет мир
ТАСС: задержанного за взятку генерала Муминджанова отправили в Москву
Филиал № 4 ОСФР по Москве и Московской области напоминает:
В Московском регионе 11,4 тысячи пап находятся в отпуске по уходу за ребенком
Токсиколог Кутушов назвал неожиданную пользу лисичек в борьбе с паразитами
ТАСС: задержанного за взятку генерала Муминджанова отправили в Москву
Росгвардейцы обеспечили охрану общественного порядка на Дне города Клин
Еще один направлявшийся к Москве БПЛА сбит ПВО — Собянин
Известный фаготист Попов госпитализирован после ДТП в центре Москвы
Сын генерала Муминджанова оказался владельцем BMW и квартиры в элитном ЖК Москвы
В КХЛ может появиться новый клуб из Москвы, России нашли замену на ОИ. Итоги дня в хоккее
Ежегодный фестиваль технических видов спорта пройдет в Москве в День города
Эксперт: В Монголии Москве интересны модернизация ТЭС и проект «Союз Восток»
Путин назвал развитие связей с Монголией одним из приоритетов РФ
Путин рассказал о работе над трехсторонними отношениями с КНР и Монголией
Путин: Россия готова обеспечить Монголию топливом и ГСМ по льготным ценам
В госпитальной школе подмосковного онкодиспансера прозвенел первый звонок
Педиатр Константинова: пример семьи имеет большое значение в борьбе с ожирением у детей
Собянин назвал лично лекарств, произведенных по офсетным контрактам
Суд арестовал курьера, пытавшегося изнасиловать девушку-инвалида в Москве
Экс-футболист сборной России: «В Москве из-за невероятных пробок на день невозможно запланировать несколько дел»
Губернатор Орловской области Андрей Клычков встретился со студентам Мезенского педколледжа
Новый персонаж сериала «Команда МАТЧ» Шоня стал талисманом «Матч ТВ»
Дмитрий Черышев: Денис не завершил карьеру и ведёт переговоры с клубами
Лукашенко советует молодежи в регионах не стремиться в Минск
"Если попробуют более жёстко, погибнет вся планета": Лукашенко предупредил США
Собянин открыл школу на юго-западе Москвы после реконструкции
Собянин: В 2025 году завершится обновление 50 зданий школ
Собянин назвал лично лекарств, произведенных по офсетным контрактам
Собянин: Более 2,4 млн упаковок лекарств получил город по офсетным контрактам
"Просто Михалыч" во второй раз покажет сибирский характер столичным нуворишам
Синоптик Ильин: аномальная жара в Москве связана с антициклоном
В воскресенье еще потеплеет: с чем связана аномальная жара в Москве в сентябре
Систему городского транспорта Москвы предложено дополнить малогабаритными электромобилями
Тайны "Золотого кольца" центральных площадей. Часть 1
Названа самая опасная улица в Москве для водителей
Телеведущий Тихомиров рассказал о лучшем времени для сбора грибов в Подмосковье
Ледовый процесс: что решил суд по делу о переходе фигуристки от Плющенко к Тутберидзе
Снайперы из Пскова научились поражать цели на сверхдальних расстояниях
Ревнивый муж залил зеленкой бывшего мэра Архангельска на съемках фильма
Архангельские работодатели жалуются на старение населения в регионе
В Ярославской области выполнен ремонт магистрального трубопровода
Выставка крымского имени «Тайны души и творчества Алемдара Караманова»
Выставка-обращение «Наш мир без террора»
1 и 2 сентября филиал РТРС «РТПЦ Республики Мордовия» и Министерство образования Республики Мордовия проведут совместную акцию, приуроченную ко Дню знаний и началу нового учебного года.
Книжная выставка-реквием "В служении верном Отчизне клянусь!"
В Подольске 14 сентября пройдет фестиваль «Тяга Фест II»
Главные новости за 02 сентября, Нижний Новгород: Буйный пациент напал на анестезиолога, ночью сгорели 5 грузовиков и другие
СЕНСАЦИЯ В ЯДЕРНОМ ОРУДИИ: "ПОСЕЙДОН РЭМЫЧ". ДОПОЛНИТЕЛЬНАЯ ТЕХНОЛОГИЯ. Очень важные данные для России и всего мира!
Жительница Ленобласти угнала машину в Москве