30 мая 2006 года Банк России выдал Национальному Клиринговому центру Свидетельство о государственной Регистрации кредитной организации №3466. Сегодня НКЦ является квалифицированным центральным контрагентом, системно значимой инфраструктурной организацией финансового рынка, благодаря которой бесперебойно работает российский денежный рынок и рынок капитала. Гала-прием, посвященный 15-летию НКЦ прошел 27 мая в отеле Four Seasons. За эти годы Банк России совместно с Национальным клиринговым центром выстроил архитектуру института центрального контрагента (ЦК), что обеспечило эффективное выполнение его функций и устойчивость к шокам.